李元纮担任宰相，与同列宰相的杜暹纷争不断，引起唐玄宗的不满，外放为曹州刺史
开元十四年（726年），李元纮升任中书侍郎、同中书门下平章事，又加银青光禄大夫，封清水县男。当时，京官职田被废置，便有朝臣建议在关中屯田，以充实国库。李元纮奏道：“边关百姓清闲，土地荒芜，以剩余劳动力耕种荒田，能够减少运输，充实军粮，因此设置屯田有益于国。但在关中，百官职田散居各地，百姓的私田都努力自耕，不能占取。如果设置屯田，就要公私相换，调发壮丁。调发劳役则家业荒废，减免租税则国赋欠缺，内地设置屯田，自古未有，恐怕得不偿失。”唐玄宗遂停止此议。
此前，吴兢担任史官，编撰《唐书》、《唐春秋》，尚未完成便因守丧离职。他上疏皇帝，请求继续修史，唐玄宗便让他到集贤院撰书。开元十五年（727年），唐玄宗命
张说致仕，并让他在家中修史。李元纮认为不妥，便提议让张说和吴兢同到史馆撰修国史，既可做到保密，又可避免资料丢失。唐玄宗采纳了他的建议。
李元纮与同列宰相的杜暹关系不睦，常在政事上产生分歧，以致纷争不断，引起唐玄宗的不满。开元十七年（729年），唐玄宗免去李元纮的宰相之职，外放为曹州刺史。
李元纮晚年生活，因病离职，后被起复为太子詹事不到十日便因病去世
此后，李元纮又调任蒲州刺史，却因病离职，并以户部尚书之职致仕。
开元二十一年（733年），李元纮被起复为太子詹事，但不到十日便因病去世，追赠太子少傅，谥号文忠。
