崔佑甫忠贞正直德宗得知齐备常衮陷害后严惩常衮，并越发的信任崔佑甫

崔佑甫因直言进谏而深受唐德宗赏识，对其极其宠信
此前，政事繁多，宰相便轮流处理日常事务。如有宰相轮休，若非重要诏令，不需一一告知，值班宰相可代其署名，并从此逐渐形成惯例。常衮贬黜崔祐甫，因同列宰相的郭子仪、朱泚从不参预朝政，便未征询他们的意见，而是依照惯例，代替二人在诏书上署名。
贬官诏书发出后，郭子仪、朱泚都表示崔祐甫不应被贬，唐德宗这才知道二人并不知情。他不知这是朝廷惯例，便认为常衮欺君罔上，将其贬为河南少尹，并授崔祐甫为门下侍郞、同平章事，让他们对调官职。崔祐甫刚刚行至昭应县，便被召回朝中，又改任中书侍郎，并修国史。  当时，唐德宗正在服丧，将政务全部托付给崔祐甫，对他的进言无有不允。 
同年十二月，崔祐甫患病。唐德宗让他乘坐肩舆进入中书省，躺着接受诏令。崔祐甫在家休假时，如若发生大事，唐德宗也会派宦官到他家中咨询，请他做出决断。 

崔佑甫去世后唐德宗破例将其追赠三师，赐谥文贞
建中元年（780年），崔祐甫病逝，时年六十岁。唐德宗认为崔祐甫忠贞正直，有重臣的节操，追赠他为太傅，赐谥文贞，而此前从未有过门下侍郎被追赠三师的先例。