虽然宇文述在首次讨伐高句丽终战败，却只是被除名为民，并在二次讨伐中将其官复原职

首次讨伐高句丽失败隋炀帝并不甘心，再次集结大军准备讨伐

因此次讨伐高句丽大败而归，隋炀帝大怒，遂将宇文述下狱。宇文述因平时得宠于隋炀帝，并且其子宇文士及娶隋炀帝之女南阳公主，所以隋炀帝不忍诛杀宇文述。十一月，隋炀帝将宇文述与于仲文等皆除名为民，并斩刘士龙以谢天下。
隋炀帝不甘心第一次征高句丽的失败，于大业九年（613年）正月，下诏再征天下兵集于涿郡，并募民为骁果，置折冲、果毅、武能、雄武等郎将率领之。并命刑部尚书卫玄等辅佐代王杨侑留守西京长安。

再次攻打高句丽时隋炀帝御驾亲征，并将宇文述官复原职

隋炀帝为派得力的将领出征高句丽，遂于二月下诏，将宇文述官复原职，待之如初。诏曰：“宇文述以兵粮不继，遂陷王师；乃军吏失于支料，非述之罪，宜复其官爵”。不久又加开府仪同三司。
三月初四，隋炀帝从洛阳出发，再次御驾亲征高句丽。行至黎阳(今河南浚县东北），留礼部尚书杨玄感于此督运粮草。四月二十七日，隋炀帝的车驾渡过辽水。二十九日，隋炀帝命宇文述和上大将军杨义臣率军由北路疾趋平壤。炀帝亲率主力进围辽东城（今辽宁辽阳），并派左光禄大夫王仁恭领兵出扶余道进攻新城（今辽宁抚顺北）。由于隋军兵强马壮，计划周密，准备充分，所以作战非常顺利。正当辽东城指日可下之际，杨玄感忽然在黎阳起兵反隋，隋炀帝大惊，乃于六月二十八日夜二更密令诸将撤军，并令宇文述率军急赴河阳，发诸郡兵讨杨玄感。