黄飞鸿不仅武功超群，并且医术也是盛名在外，致力于救助劳苦大众

黄飞鸿不仅武功超群，医术也是十分精湛
黄飞鸿不仅武功超群，医术亦相当精湛。光绪年中，在广州仁安里设“宝芝林”医药馆。福军首领刘永福亲为宝芝林题写“技艺皆精”的匾额，并聘飞鸿为福军技击总教练，后随刘到台湾英勇杀倭。

黄飞鸿开设“宝芝林”医馆，悬壶济世，治病救人
其驳骨疗伤之技，时称一绝。光绪年中，在广州仁安里设“宝芝林”医药馆，悬壶济世，治病救人，上至将军，下至百姓，功效显著。黄飞鸿有一个叫伍铨萃的弟子，是文人出身，1892年中了进士，他曾经送给黄飞鸿两句诗"宝剑腾霄汉，芝花遍上林”而黄飞鸿在创办跌打医馆时就取了两个开头的字和最后一个字作为医馆的名称。
宝芝林和黄飞鸿在医治跌打损伤方面有一套，当今流传的宝芝林伤科跌打酒（牛大力1两，千斤拔1两，半风荷 1两，宽根藤1两，田七5钱，金耳环5钱，以上诸药浸酒1斤5两，15天后可用）。相传是由陆阿采所传，而黄飞鸿本人也先后研制出大力丸、通脉丹等跌打药，1888年，著名的黑旗军统领刘永福受伤后多方医治不愈，黄飞鸿治愈了他的伤病，黄飞鸿不但因此得到了两广总督张之洞书写的医艺精通的牌匾，而且被刘永福聘请为军医官和技击总教练。
宝芝林和黄飞鸿的医术声名在外和黄飞鸿本人的医德也有很大关系，他不但不藏私，还向社会公开跌打涵浸泡方法和防暑凉茶验方，希望有助于劳苦大众。