蒙哥以弟忽必烈领漠南汉地军政事物，南征大理，元朝统治云南达128年，励精图治，高丽降附于大蒙古国

蒙哥即位后，忽必烈领漠南汉地军政事务，两位畏兀儿人因为与窝阔台家有牵连被害，后高丽国王投降大蒙古国，高丽成为大蒙古国藩属国，但保留高丽原有政府体系和传统文化
1251年7月1日，蒙哥即位后，窝阔台系诸宗王拒绝承认，后率兵镇压之，又以弟忽必烈领漠南汉地军政事务。
他在位时，两位畏兀儿人因为与窝阔台家有牵连被害，一位名为镇海，一位名为萨伦迪的亦都护，后者因为被指准备在星期五礼拜对别失八里的人进行屠杀，后来被送到和林处死。
1258年，高丽崔氏政权跨台，高丽国王投降大蒙古国，双方达成和平协议。高丽成为大蒙古国藩属国，但保留高丽原有政府体系和传统文化，“从其国俗”、“自奏选属官”。

蒙哥命弟忽必烈南征大理国，国王段兴智投降，大理国灭亡，云贵高原并入大蒙古国版图，元朝统治云南地区长达128年
1252年六月，命弟忽必烈南征大理国。七月，忽必烈率军出发。1253年八月，忽必烈率军从陕西出发，进攻位于今云南等地的大理国。1254年1月2日，忽必烈攻克大理城，国王段兴智投降，大理国灭亡，云贵高原并入大蒙古国版图。1256年，段兴智前往漠北和林皇宫觐见蒙哥，被蒙哥任命为大理总管，子孙世袭。
从1254年忽必烈灭大理国，到1382年驻守云南的元朝梁王把匝剌瓦尔密兵败自杀，元朝大理总管段世战败归降明军，元朝统治云南地区长达128年。