刘国能归顺朝廷，不再二心，多次从军参与剿匪，后被起义军所杀

刘国能诚心归降朝廷，自此屡次率军剿匪，立有战功
此时，总理熊文灿受命剿贼，因其有威名，贼军甚惮之，见其下招降令，颇有欲归正者。刘国能素来与张献忠有隙，虑为其所并，后又被左良玉战败，乃以崇祯十一年正月就抚于随州，顿首告熊文灿说：“愚民陷不义且十载，赖公湔洗更生。愿悉众入军籍，身隶麾下尽死力。”熊文灿大喜，慰抚之，署为守备，令隶属左良玉。从此，刘国能受朝廷约束，不再有异志。不久，张献忠、罗汝才亦降，皆据邑自固，只有刘国能从军征剿，数有功。崇祯十二年十二月从左良玉勤王，授副总兵。同年四月与秦良玉会师南阳，击李万庆，贼溃奔，投降。这年秋天，张献忠、罗汝才再次叛乱，熊文灿命刘国能率李万庆等人共同进讨，守卫郧阳。既而李自成侵扰河南，刘国能退守叶县。

刘国能归顺朝廷后，于叶县被起义军包围俘获，拒降被杀

起初，刘国能参加反乱时，与李自成、罗汝才等人结为兄弟。刘国能归顺朝廷后，起义军首领对他非常忌恨。崇祯十四年九月以主力包围叶县，四面力攻，刘国能力不能支，城遂陷，被擒。李自成仍然好言相劝：“若，我故人也，何不降？”刘国能此时以忠义自许，便瞋目骂曰：“我初与若同为贼，今则王臣也，何故降贼！”遂被杀。
消息传出后，崇祯皇帝特诏加勉，追赠左都督，特进荣禄大夫，建祠纪念。