徐大椿受乾隆帝欣赏，乾隆帝想要将其留京任职，徐大椿坚决推辞

徐大椿再度应召入京，自知身体状况不容乐观，遂命其子带着棺材同行
徐大椿曾两度奉诏赴京。首次为乾隆二十五年(1760)，直言质朴而得乾隆帝嘉赏，原拟留职京师，坚辞放归隐居画眉泉；第二次乾隆三十六年，年已七十九岁，自知不豫，携子徐爔同行，到京后三日死。死前自拟墓前对联曰：“满山芳草仙人药，一径清风处士坟。”可谓平生写照云。

清朝颇具盛名的医学家徐大椿的个人著作编辑记录如下；
《徐灵胎医学全书》详尽介绍了徐氏的生平经历，以及其学术建树和著作考证等，对于后世研究徐灵胎的学术思想有很大启发。书末还附有“论文题录”，全面摘录了1950-1997年间公开发表的现代学者对徐氏学术思想、诊治经验以及生平著述等各方面研究的论文题目，以利读者查阅。
《徐灵胎医学全书》集古籍整理与现代研究于一体，完整、准确地反映了徐灵胎的医学学术特点，是一部颇有学术价值的医籍。可供广大中医爱好者参考阅读。